饥荒整合版和灵幻版的核心区别在于模组内容和游戏机制设计。整合版包含所有DLC内容，提供更完整的原版体验，适合追求深度生存挑战的玩家。灵幻版则整合了巨人国与海难地图，并内置大量人物解锁和辅助模组，更适合偏好自由探索和自定义玩法的用户。两者在核心玩法上没有本质差异，但灵幻版通过模组优化了部分操作体验，例如快速存档和全角色解锁。
从兼容性来看，整合版对手机配置要求较高，部分低配设备可能出现字体显示不全的问题，灵幻版是更稳定的选择。灵幻版针对移动端进行了优化，加载速度更快，画质表现也更流畅。整合版的存档功能为原生设计，而灵幻版需通过模组实现快速读档，两者在存档稳定性上并无显著差异。
游戏内容方面，整合版保留了原版生存节奏，玩家需逐步解锁角色和资源，适合喜欢循序渐进体验的玩家。灵幻版则直接开放全部角色和部分高级道具，降低了前期生存压力，但可能削弱长期挑战的乐趣。整合版的季节BOSS和事件更贴近官方设定，灵幻版因模组影响可能出现生物刷新频率异常或机制变动。
联机功能上，整合版依赖官方服务器或局域网联机，稳定性较强但限制较多。灵幻版支持存档导出分享，并可跨地图联机，灵活性更高。两者均支持多人合作，但灵幻版的模组可能影响联机兼容性，需确保所有玩家使用相同模组配置。
最终选择取决于玩家偏好：若追求原汁原味的生存挑战和官方内容完整性，整合版更合适；若倾向于快速体验多样化模组和便捷功能，灵幻版是更好的选择。两者均能提供独特的游戏体验，差异仅体现在内容呈现方式和操作优化上。